Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SOGA3Q5TF21 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
SOGA3Q5TF21 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
SOGA3Q5TF21 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SOGA3Q5TF21 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
SOGA3Q5TF21 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SOGA3Q5TF21 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SOGA3Q5TF21 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SOGA3Q5TF21 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SOGA3Q5TF21 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SOGA3Q5TF21 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SOGA3Q5TF21 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SOGA3Q5TF21 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SOGA3Q5TF21 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SOGA3Q5TF21 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SOGA3Q5TF21 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SOGA3Q5TF21 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
SOGA3Q5TF21 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SOGA3Q5TF21 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SOGA3Q5TF21 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SOGA3Q5TF21 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
SOGA3Q5TF21 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SOGA3Q5TF21 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SOGA3Q5TF21 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SOGA3Q5TF21 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SOGA3Q5TF21 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SOGA3Q5TF21 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SOGA3Q5TF21 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SOGA3Q5TF21 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SOGA3Q5TF21 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SOGA3Q5TF21 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SOGA3Q5TF21 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SOGA3Q5TF21 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SOGA3Q5TF21 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SOGA3Q5TF21 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SOGA3Q5TF21 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SOGA3Q5TF21 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SOGA3Q5TF21 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SOGA3Q5TF21 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SOGA3Q5TF21 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
SOGA3Q5TF21 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SOGA3Q5TF21 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SOGA3Q5TF21 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SOGA3Q5TF21 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SOGA3Q5TF21 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SOGA3Q5TF21 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SOGA3Q5TF21 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SOGA3Q5TF21 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SOGA3Q5TF21 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SOGA3Q5TF21 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SOGA3Q5TF21 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SOGA3Q5TF21 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SOGA3Q5TF21 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SOGA3Q5TF21 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SOGA3Q5TF21 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SOGA3Q5TF21 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SOGA3Q5TF21 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SOGA3Q5TF21 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SOGA3Q5TF21 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SOGA3Q5TF21 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SOGA3Q5TF21 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SOGA3Q5TF21 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
SOGA3Q5TF21 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SOGA3Q5TF21 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SOGA3Q5TF21 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SOGA3Q5TF21 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SOGA3Q5TF21 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SOGA3Q5TF21 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
SOGA3Q5TF21 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SOGA3Q5TF21 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
SOGA3Q5TF21 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SOGA3Q5TF21 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SOGA3Q5TF21 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SOGA3Q5TF21 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SOGA3Q5TF21 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SOGA3Q5TF21 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
SOGA3Q5TF21 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SOGA3Q5TF21 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SOGA3Q5TF21 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SOGA3Q5TF21 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SOGA3Q5TF21 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SOGA3Q5TF21 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SOGA3Q5TF21 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SOGA3Q5TF21 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SOGA3Q5TF21 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SOGA3Q5TF21 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SOGA3Q5TF21 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SOGA3Q5TF21 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SOGA3Q5TF21 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SOGA3Q5TF21 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SOGA3Q5TF21 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SOGA3Q5TF21 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SOGA3Q5TF21 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SOGA3Q5TF21 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SOGA3Q5TF21 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SOGA3Q5TF21 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SOGA3Q5TF21 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
SOGA3Q5TF21 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SOGA3Q5TF21 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SOGA3Q5TF21 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms