Protein–RNA interactions for Protein: Q5TCQ9

MAGI3, Membrane-associated guanylate kinase, WW and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGI3Q5TCQ9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
MAGI3Q5TCQ9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
MAGI3Q5TCQ9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
MAGI3Q5TCQ9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC39.19■■■■□ 3.86
MAGI3Q5TCQ9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
MAGI3Q5TCQ9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
MAGI3Q5TCQ9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
MAGI3Q5TCQ9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
MAGI3Q5TCQ9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
MAGI3Q5TCQ9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
MAGI3Q5TCQ9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
MAGI3Q5TCQ9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
MAGI3Q5TCQ9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
MAGI3Q5TCQ9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
MAGI3Q5TCQ9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
MAGI3Q5TCQ9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
MAGI3Q5TCQ9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
MAGI3Q5TCQ9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC39.15■■■■□ 3.86
MAGI3Q5TCQ9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
MAGI3Q5TCQ9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
MAGI3Q5TCQ9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
MAGI3Q5TCQ9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
MAGI3Q5TCQ9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.86
MAGI3Q5TCQ9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC39.13■■■■□ 3.85
MAGI3Q5TCQ9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
MAGI3Q5TCQ9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
MAGI3Q5TCQ9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
MAGI3Q5TCQ9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC39.11■■■■□ 3.85
MAGI3Q5TCQ9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
MAGI3Q5TCQ9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
MAGI3Q5TCQ9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
MAGI3Q5TCQ9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
MAGI3Q5TCQ9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
MAGI3Q5TCQ9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
MAGI3Q5TCQ9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
MAGI3Q5TCQ9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
MAGI3Q5TCQ9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
MAGI3Q5TCQ9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
MAGI3Q5TCQ9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.84
MAGI3Q5TCQ9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
MAGI3Q5TCQ9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
MAGI3Q5TCQ9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
MAGI3Q5TCQ9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
MAGI3Q5TCQ9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
MAGI3Q5TCQ9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
MAGI3Q5TCQ9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
MAGI3Q5TCQ9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
MAGI3Q5TCQ9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
MAGI3Q5TCQ9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
MAGI3Q5TCQ9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
MAGI3Q5TCQ9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
MAGI3Q5TCQ9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
MAGI3Q5TCQ9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
MAGI3Q5TCQ9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
MAGI3Q5TCQ9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
MAGI3Q5TCQ9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
MAGI3Q5TCQ9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
MAGI3Q5TCQ9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
MAGI3Q5TCQ9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
MAGI3Q5TCQ9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
MAGI3Q5TCQ9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
MAGI3Q5TCQ9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
MAGI3Q5TCQ9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
MAGI3Q5TCQ9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
MAGI3Q5TCQ9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
MAGI3Q5TCQ9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
MAGI3Q5TCQ9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
MAGI3Q5TCQ9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
MAGI3Q5TCQ9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
MAGI3Q5TCQ9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
MAGI3Q5TCQ9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
MAGI3Q5TCQ9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
MAGI3Q5TCQ9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC38.98■■■■□ 3.83
MAGI3Q5TCQ9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
MAGI3Q5TCQ9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
MAGI3Q5TCQ9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
MAGI3Q5TCQ9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
MAGI3Q5TCQ9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
MAGI3Q5TCQ9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
MAGI3Q5TCQ9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
MAGI3Q5TCQ9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
MAGI3Q5TCQ9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
MAGI3Q5TCQ9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
MAGI3Q5TCQ9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC38.94■■■■□ 3.82
MAGI3Q5TCQ9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
MAGI3Q5TCQ9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
MAGI3Q5TCQ9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
MAGI3Q5TCQ9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC38.94■■■■□ 3.82
MAGI3Q5TCQ9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
MAGI3Q5TCQ9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
MAGI3Q5TCQ9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
MAGI3Q5TCQ9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
MAGI3Q5TCQ9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
MAGI3Q5TCQ9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
MAGI3Q5TCQ9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
MAGI3Q5TCQ9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
MAGI3Q5TCQ9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
MAGI3Q5TCQ9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
MAGI3Q5TCQ9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
MAGI3Q5TCQ9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms