Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC63

GRTP1, Growth hormone-regulated TBC protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRTP1Q5TC63 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRTP1Q5TC63 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRTP1Q5TC63 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRTP1Q5TC63 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRTP1Q5TC63 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRTP1Q5TC63 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRTP1Q5TC63 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRTP1Q5TC63 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRTP1Q5TC63 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRTP1Q5TC63 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRTP1Q5TC63 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRTP1Q5TC63 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRTP1Q5TC63 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRTP1Q5TC63 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRTP1Q5TC63 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRTP1Q5TC63 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRTP1Q5TC63 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRTP1Q5TC63 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRTP1Q5TC63 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRTP1Q5TC63 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRTP1Q5TC63 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRTP1Q5TC63 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRTP1Q5TC63 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRTP1Q5TC63 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRTP1Q5TC63 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRTP1Q5TC63 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GRTP1Q5TC63 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRTP1Q5TC63 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GRTP1Q5TC63 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRTP1Q5TC63 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRTP1Q5TC63 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRTP1Q5TC63 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRTP1Q5TC63 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRTP1Q5TC63 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRTP1Q5TC63 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRTP1Q5TC63 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRTP1Q5TC63 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRTP1Q5TC63 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRTP1Q5TC63 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRTP1Q5TC63 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRTP1Q5TC63 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRTP1Q5TC63 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRTP1Q5TC63 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRTP1Q5TC63 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRTP1Q5TC63 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRTP1Q5TC63 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRTP1Q5TC63 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRTP1Q5TC63 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRTP1Q5TC63 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRTP1Q5TC63 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRTP1Q5TC63 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRTP1Q5TC63 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRTP1Q5TC63 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRTP1Q5TC63 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRTP1Q5TC63 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRTP1Q5TC63 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRTP1Q5TC63 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRTP1Q5TC63 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRTP1Q5TC63 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRTP1Q5TC63 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRTP1Q5TC63 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GRTP1Q5TC63 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRTP1Q5TC63 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRTP1Q5TC63 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRTP1Q5TC63 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRTP1Q5TC63 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRTP1Q5TC63 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRTP1Q5TC63 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRTP1Q5TC63 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRTP1Q5TC63 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRTP1Q5TC63 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRTP1Q5TC63 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRTP1Q5TC63 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRTP1Q5TC63 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRTP1Q5TC63 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRTP1Q5TC63 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRTP1Q5TC63 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms