Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC122Q5T0U0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC122Q5T0U0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC122Q5T0U0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC122Q5T0U0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC122Q5T0U0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC122Q5T0U0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC122Q5T0U0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC122Q5T0U0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC122Q5T0U0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC122Q5T0U0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC122Q5T0U0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC122Q5T0U0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC122Q5T0U0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC122Q5T0U0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC122Q5T0U0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC122Q5T0U0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC122Q5T0U0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC122Q5T0U0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC122Q5T0U0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC122Q5T0U0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC122Q5T0U0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC122Q5T0U0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC122Q5T0U0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC122Q5T0U0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC122Q5T0U0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC122Q5T0U0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC122Q5T0U0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC122Q5T0U0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC122Q5T0U0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC122Q5T0U0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC122Q5T0U0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC122Q5T0U0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC122Q5T0U0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC122Q5T0U0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC122Q5T0U0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC122Q5T0U0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC122Q5T0U0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC122Q5T0U0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC122Q5T0U0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC122Q5T0U0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC122Q5T0U0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC122Q5T0U0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC122Q5T0U0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC122Q5T0U0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC122Q5T0U0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC122Q5T0U0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC122Q5T0U0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC122Q5T0U0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC122Q5T0U0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC122Q5T0U0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC122Q5T0U0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC122Q5T0U0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC122Q5T0U0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC122Q5T0U0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC122Q5T0U0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC122Q5T0U0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC122Q5T0U0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC122Q5T0U0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC122Q5T0U0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC122Q5T0U0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC122Q5T0U0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC122Q5T0U0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC122Q5T0U0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC122Q5T0U0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC122Q5T0U0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC122Q5T0U0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC122Q5T0U0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC122Q5T0U0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC122Q5T0U0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC122Q5T0U0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC122Q5T0U0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC122Q5T0U0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC122Q5T0U0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC122Q5T0U0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC122Q5T0U0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC122Q5T0U0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC122Q5T0U0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC122Q5T0U0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC122Q5T0U0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC122Q5T0U0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC122Q5T0U0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC122Q5T0U0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC122Q5T0U0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC122Q5T0U0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC122Q5T0U0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC122Q5T0U0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC122Q5T0U0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC122Q5T0U0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC122Q5T0U0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC122Q5T0U0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC122Q5T0U0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC122Q5T0U0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC122Q5T0U0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC122Q5T0U0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC122Q5T0U0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC122Q5T0U0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC122Q5T0U0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC122Q5T0U0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC122Q5T0U0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms