Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C1orf220Q5T0J3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C1orf220Q5T0J3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C1orf220Q5T0J3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C1orf220Q5T0J3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C1orf220Q5T0J3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
C1orf220Q5T0J3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
C1orf220Q5T0J3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
C1orf220Q5T0J3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
C1orf220Q5T0J3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C1orf220Q5T0J3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C1orf220Q5T0J3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C1orf220Q5T0J3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
C1orf220Q5T0J3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C1orf220Q5T0J3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C1orf220Q5T0J3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C1orf220Q5T0J3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C1orf220Q5T0J3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C1orf220Q5T0J3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C1orf220Q5T0J3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C1orf220Q5T0J3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C1orf220Q5T0J3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C1orf220Q5T0J3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C1orf220Q5T0J3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C1orf220Q5T0J3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C1orf220Q5T0J3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
C1orf220Q5T0J3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C1orf220Q5T0J3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
C1orf220Q5T0J3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
C1orf220Q5T0J3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C1orf220Q5T0J3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C1orf220Q5T0J3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C1orf220Q5T0J3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C1orf220Q5T0J3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
C1orf220Q5T0J3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C1orf220Q5T0J3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C1orf220Q5T0J3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C1orf220Q5T0J3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C1orf220Q5T0J3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C1orf220Q5T0J3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C1orf220Q5T0J3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C1orf220Q5T0J3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
C1orf220Q5T0J3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C1orf220Q5T0J3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C1orf220Q5T0J3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
C1orf220Q5T0J3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C1orf220Q5T0J3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C1orf220Q5T0J3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C1orf220Q5T0J3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C1orf220Q5T0J3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C1orf220Q5T0J3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C1orf220Q5T0J3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C1orf220Q5T0J3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C1orf220Q5T0J3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C1orf220Q5T0J3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C1orf220Q5T0J3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C1orf220Q5T0J3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C1orf220Q5T0J3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C1orf220Q5T0J3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C1orf220Q5T0J3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C1orf220Q5T0J3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C1orf220Q5T0J3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C1orf220Q5T0J3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C1orf220Q5T0J3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C1orf220Q5T0J3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
C1orf220Q5T0J3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C1orf220Q5T0J3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C1orf220Q5T0J3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C1orf220Q5T0J3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C1orf220Q5T0J3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C1orf220Q5T0J3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C1orf220Q5T0J3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C1orf220Q5T0J3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C1orf220Q5T0J3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C1orf220Q5T0J3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C1orf220Q5T0J3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C1orf220Q5T0J3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C1orf220Q5T0J3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C1orf220Q5T0J3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C1orf220Q5T0J3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C1orf220Q5T0J3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C1orf220Q5T0J3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C1orf220Q5T0J3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C1orf220Q5T0J3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C1orf220Q5T0J3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C1orf220Q5T0J3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C1orf220Q5T0J3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C1orf220Q5T0J3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C1orf220Q5T0J3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C1orf220Q5T0J3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C1orf220Q5T0J3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
C1orf220Q5T0J3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C1orf220Q5T0J3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C1orf220Q5T0J3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C1orf220Q5T0J3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C1orf220Q5T0J3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
C1orf220Q5T0J3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C1orf220Q5T0J3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C1orf220Q5T0J3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C1orf220Q5T0J3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms