Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP13A4Q4VNC1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP13A4Q4VNC1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP13A4Q4VNC1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP13A4Q4VNC1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP13A4Q4VNC1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP13A4Q4VNC1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP13A4Q4VNC1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP13A4Q4VNC1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP13A4Q4VNC1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP13A4Q4VNC1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP13A4Q4VNC1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP13A4Q4VNC1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP13A4Q4VNC1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP13A4Q4VNC1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP13A4Q4VNC1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP13A4Q4VNC1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP13A4Q4VNC1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP13A4Q4VNC1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP13A4Q4VNC1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP13A4Q4VNC1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP13A4Q4VNC1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP13A4Q4VNC1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP13A4Q4VNC1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP13A4Q4VNC1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP13A4Q4VNC1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP13A4Q4VNC1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP13A4Q4VNC1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP13A4Q4VNC1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP13A4Q4VNC1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP13A4Q4VNC1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP13A4Q4VNC1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP13A4Q4VNC1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP13A4Q4VNC1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP13A4Q4VNC1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP13A4Q4VNC1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP13A4Q4VNC1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP13A4Q4VNC1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP13A4Q4VNC1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP13A4Q4VNC1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP13A4Q4VNC1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP13A4Q4VNC1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP13A4Q4VNC1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP13A4Q4VNC1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP13A4Q4VNC1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP13A4Q4VNC1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP13A4Q4VNC1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP13A4Q4VNC1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP13A4Q4VNC1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP13A4Q4VNC1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP13A4Q4VNC1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP13A4Q4VNC1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP13A4Q4VNC1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP13A4Q4VNC1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP13A4Q4VNC1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP13A4Q4VNC1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP13A4Q4VNC1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP13A4Q4VNC1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP13A4Q4VNC1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP13A4Q4VNC1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP13A4Q4VNC1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP13A4Q4VNC1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP13A4Q4VNC1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP13A4Q4VNC1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP13A4Q4VNC1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP13A4Q4VNC1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP13A4Q4VNC1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP13A4Q4VNC1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP13A4Q4VNC1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP13A4Q4VNC1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP13A4Q4VNC1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP13A4Q4VNC1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP13A4Q4VNC1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP13A4Q4VNC1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP13A4Q4VNC1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP13A4Q4VNC1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP13A4Q4VNC1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP13A4Q4VNC1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP13A4Q4VNC1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP13A4Q4VNC1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP13A4Q4VNC1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP13A4Q4VNC1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms