Protein–RNA interactions for Protein: Q4AE62

GTDC1, Glycosyltransferase-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTDC1Q4AE62 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTDC1Q4AE62 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTDC1Q4AE62 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTDC1Q4AE62 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GTDC1Q4AE62 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTDC1Q4AE62 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTDC1Q4AE62 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTDC1Q4AE62 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTDC1Q4AE62 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTDC1Q4AE62 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTDC1Q4AE62 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTDC1Q4AE62 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTDC1Q4AE62 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTDC1Q4AE62 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTDC1Q4AE62 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTDC1Q4AE62 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTDC1Q4AE62 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTDC1Q4AE62 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTDC1Q4AE62 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTDC1Q4AE62 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTDC1Q4AE62 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTDC1Q4AE62 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTDC1Q4AE62 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTDC1Q4AE62 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTDC1Q4AE62 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTDC1Q4AE62 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTDC1Q4AE62 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTDC1Q4AE62 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTDC1Q4AE62 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTDC1Q4AE62 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTDC1Q4AE62 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTDC1Q4AE62 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTDC1Q4AE62 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GTDC1Q4AE62 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTDC1Q4AE62 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTDC1Q4AE62 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTDC1Q4AE62 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTDC1Q4AE62 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTDC1Q4AE62 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTDC1Q4AE62 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTDC1Q4AE62 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTDC1Q4AE62 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTDC1Q4AE62 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTDC1Q4AE62 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTDC1Q4AE62 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTDC1Q4AE62 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTDC1Q4AE62 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTDC1Q4AE62 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTDC1Q4AE62 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTDC1Q4AE62 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTDC1Q4AE62 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTDC1Q4AE62 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTDC1Q4AE62 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTDC1Q4AE62 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTDC1Q4AE62 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTDC1Q4AE62 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTDC1Q4AE62 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTDC1Q4AE62 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTDC1Q4AE62 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTDC1Q4AE62 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTDC1Q4AE62 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTDC1Q4AE62 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTDC1Q4AE62 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTDC1Q4AE62 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTDC1Q4AE62 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTDC1Q4AE62 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTDC1Q4AE62 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTDC1Q4AE62 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTDC1Q4AE62 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTDC1Q4AE62 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTDC1Q4AE62 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTDC1Q4AE62 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTDC1Q4AE62 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTDC1Q4AE62 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTDC1Q4AE62 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTDC1Q4AE62 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTDC1Q4AE62 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTDC1Q4AE62 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTDC1Q4AE62 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTDC1Q4AE62 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTDC1Q4AE62 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTDC1Q4AE62 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTDC1Q4AE62 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTDC1Q4AE62 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTDC1Q4AE62 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTDC1Q4AE62 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTDC1Q4AE62 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTDC1Q4AE62 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTDC1Q4AE62 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTDC1Q4AE62 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTDC1Q4AE62 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTDC1Q4AE62 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTDC1Q4AE62 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTDC1Q4AE62 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTDC1Q4AE62 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTDC1Q4AE62 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTDC1Q4AE62 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GTDC1Q4AE62 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTDC1Q4AE62 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTDC1Q4AE62 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms