Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDO1Q16878 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDO1Q16878 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDO1Q16878 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDO1Q16878 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDO1Q16878 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDO1Q16878 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDO1Q16878 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDO1Q16878 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDO1Q16878 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDO1Q16878 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDO1Q16878 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDO1Q16878 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDO1Q16878 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDO1Q16878 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDO1Q16878 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDO1Q16878 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDO1Q16878 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDO1Q16878 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDO1Q16878 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDO1Q16878 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDO1Q16878 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDO1Q16878 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDO1Q16878 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDO1Q16878 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDO1Q16878 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDO1Q16878 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDO1Q16878 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDO1Q16878 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDO1Q16878 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDO1Q16878 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDO1Q16878 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDO1Q16878 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDO1Q16878 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDO1Q16878 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDO1Q16878 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDO1Q16878 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDO1Q16878 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDO1Q16878 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDO1Q16878 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDO1Q16878 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDO1Q16878 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDO1Q16878 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDO1Q16878 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDO1Q16878 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDO1Q16878 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDO1Q16878 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDO1Q16878 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDO1Q16878 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDO1Q16878 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDO1Q16878 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDO1Q16878 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDO1Q16878 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDO1Q16878 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CDO1Q16878 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CDO1Q16878 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDO1Q16878 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDO1Q16878 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDO1Q16878 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDO1Q16878 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDO1Q16878 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDO1Q16878 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDO1Q16878 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDO1Q16878 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDO1Q16878 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDO1Q16878 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDO1Q16878 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDO1Q16878 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDO1Q16878 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDO1Q16878 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDO1Q16878 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDO1Q16878 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDO1Q16878 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDO1Q16878 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDO1Q16878 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDO1Q16878 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDO1Q16878 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDO1Q16878 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDO1Q16878 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDO1Q16878 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDO1Q16878 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CDO1Q16878 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDO1Q16878 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDO1Q16878 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDO1Q16878 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDO1Q16878 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDO1Q16878 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDO1Q16878 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDO1Q16878 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDO1Q16878 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDO1Q16878 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDO1Q16878 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDO1Q16878 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDO1Q16878 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDO1Q16878 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDO1Q16878 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDO1Q16878 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDO1Q16878 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDO1Q16878 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDO1Q16878 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
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