Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIF1AQ16665 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIF1AQ16665 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIF1AQ16665 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIF1AQ16665 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIF1AQ16665 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIF1AQ16665 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIF1AQ16665 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIF1AQ16665 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIF1AQ16665 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIF1AQ16665 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIF1AQ16665 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIF1AQ16665 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIF1AQ16665 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HIF1AQ16665 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIF1AQ16665 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIF1AQ16665 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HIF1AQ16665 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HIF1AQ16665 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIF1AQ16665 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HIF1AQ16665 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HIF1AQ16665 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HIF1AQ16665 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIF1AQ16665 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIF1AQ16665 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIF1AQ16665 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIF1AQ16665 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIF1AQ16665 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIF1AQ16665 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIF1AQ16665 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIF1AQ16665 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HIF1AQ16665 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIF1AQ16665 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIF1AQ16665 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIF1AQ16665 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIF1AQ16665 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIF1AQ16665 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIF1AQ16665 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIF1AQ16665 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIF1AQ16665 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIF1AQ16665 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIF1AQ16665 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIF1AQ16665 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIF1AQ16665 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIF1AQ16665 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIF1AQ16665 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIF1AQ16665 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIF1AQ16665 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIF1AQ16665 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HIF1AQ16665 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIF1AQ16665 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIF1AQ16665 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIF1AQ16665 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIF1AQ16665 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIF1AQ16665 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIF1AQ16665 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIF1AQ16665 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIF1AQ16665 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIF1AQ16665 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
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