Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF239Q16600 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF239Q16600 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF239Q16600 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF239Q16600 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF239Q16600 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF239Q16600 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF239Q16600 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF239Q16600 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF239Q16600 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF239Q16600 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF239Q16600 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF239Q16600 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF239Q16600 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF239Q16600 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF239Q16600 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF239Q16600 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF239Q16600 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF239Q16600 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF239Q16600 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF239Q16600 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF239Q16600 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF239Q16600 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF239Q16600 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF239Q16600 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF239Q16600 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF239Q16600 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF239Q16600 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF239Q16600 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF239Q16600 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF239Q16600 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF239Q16600 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF239Q16600 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF239Q16600 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF239Q16600 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF239Q16600 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF239Q16600 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF239Q16600 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF239Q16600 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF239Q16600 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF239Q16600 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF239Q16600 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF239Q16600 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF239Q16600 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF239Q16600 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF239Q16600 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF239Q16600 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF239Q16600 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF239Q16600 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF239Q16600 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF239Q16600 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF239Q16600 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF239Q16600 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF239Q16600 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF239Q16600 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF239Q16600 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF239Q16600 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF239Q16600 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF239Q16600 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF239Q16600 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF239Q16600 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF239Q16600 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF239Q16600 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF239Q16600 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF239Q16600 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF239Q16600 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF239Q16600 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF239Q16600 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF239Q16600 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF239Q16600 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF239Q16600 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF239Q16600 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF239Q16600 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF239Q16600 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF239Q16600 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF239Q16600 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF239Q16600 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF239Q16600 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF239Q16600 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF239Q16600 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF239Q16600 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF239Q16600 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF239Q16600 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF239Q16600 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF239Q16600 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF239Q16600 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF239Q16600 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF239Q16600 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF239Q16600 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF239Q16600 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF239Q16600 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF239Q16600 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF239Q16600 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF239Q16600 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF239Q16600 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF239Q16600 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF239Q16600 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF239Q16600 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF239Q16600 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF239Q16600 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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