Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
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