Protein–RNA interactions for Protein: Q15653

NFKBIB, NF-kappa-B inhibitor beta, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIBQ15653 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NFKBIBQ15653 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NFKBIBQ15653 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NFKBIBQ15653 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NFKBIBQ15653 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NFKBIBQ15653 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NFKBIBQ15653 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NFKBIBQ15653 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NFKBIBQ15653 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NFKBIBQ15653 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NFKBIBQ15653 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NFKBIBQ15653 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NFKBIBQ15653 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NFKBIBQ15653 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NFKBIBQ15653 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NFKBIBQ15653 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NFKBIBQ15653 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NFKBIBQ15653 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NFKBIBQ15653 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.3 ms