Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCA4Q14CN2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCA4Q14CN2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCA4Q14CN2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCA4Q14CN2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCA4Q14CN2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCA4Q14CN2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCA4Q14CN2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCA4Q14CN2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCA4Q14CN2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCA4Q14CN2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCA4Q14CN2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCA4Q14CN2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCA4Q14CN2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCA4Q14CN2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
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