Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE6HQ13956 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE6HQ13956 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE6HQ13956 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE6HQ13956 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE6HQ13956 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE6HQ13956 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE6HQ13956 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE6HQ13956 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE6HQ13956 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE6HQ13956 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE6HQ13956 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE6HQ13956 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE6HQ13956 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE6HQ13956 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE6HQ13956 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE6HQ13956 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE6HQ13956 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE6HQ13956 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE6HQ13956 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE6HQ13956 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE6HQ13956 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE6HQ13956 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE6HQ13956 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE6HQ13956 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE6HQ13956 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE6HQ13956 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE6HQ13956 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE6HQ13956 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE6HQ13956 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE6HQ13956 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE6HQ13956 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE6HQ13956 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PDE6HQ13956 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDE6HQ13956 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDE6HQ13956 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDE6HQ13956 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDE6HQ13956 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDE6HQ13956 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDE6HQ13956 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDE6HQ13956 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PDE6HQ13956 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDE6HQ13956 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDE6HQ13956 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDE6HQ13956 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDE6HQ13956 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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