Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNW1Q13573 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNW1Q13573 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNW1Q13573 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNW1Q13573 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNW1Q13573 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNW1Q13573 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNW1Q13573 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNW1Q13573 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNW1Q13573 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNW1Q13573 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNW1Q13573 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNW1Q13573 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SNW1Q13573 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SNW1Q13573 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SNW1Q13573 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNW1Q13573 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNW1Q13573 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNW1Q13573 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SNW1Q13573 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNW1Q13573 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNW1Q13573 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNW1Q13573 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNW1Q13573 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNW1Q13573 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNW1Q13573 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNW1Q13573 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNW1Q13573 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNW1Q13573 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNW1Q13573 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNW1Q13573 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNW1Q13573 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNW1Q13573 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNW1Q13573 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SNW1Q13573 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNW1Q13573 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNW1Q13573 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNW1Q13573 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNW1Q13573 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNW1Q13573 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNW1Q13573 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNW1Q13573 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SNW1Q13573 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNW1Q13573 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNW1Q13573 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNW1Q13573 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SNW1Q13573 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNW1Q13573 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNW1Q13573 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNW1Q13573 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNW1Q13573 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNW1Q13573 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SNW1Q13573 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SNW1Q13573 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SNW1Q13573 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SNW1Q13573 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNW1Q13573 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNW1Q13573 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNW1Q13573 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNW1Q13573 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNW1Q13573 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNW1Q13573 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNW1Q13573 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNW1Q13573 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNW1Q13573 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNW1Q13573 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNW1Q13573 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNW1Q13573 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNW1Q13573 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNW1Q13573 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNW1Q13573 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNW1Q13573 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNW1Q13573 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNW1Q13573 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNW1Q13573 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNW1Q13573 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNW1Q13573 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNW1Q13573 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SNW1Q13573 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNW1Q13573 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNW1Q13573 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNW1Q13573 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SNW1Q13573 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNW1Q13573 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNW1Q13573 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNW1Q13573 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNW1Q13573 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNW1Q13573 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNW1Q13573 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNW1Q13573 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNW1Q13573 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNW1Q13573 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNW1Q13573 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNW1Q13573 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNW1Q13573 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNW1Q13573 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNW1Q13573 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNW1Q13573 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNW1Q13573 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNW1Q13573 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms