Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF3Q13114 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF3Q13114 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF3Q13114 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF3Q13114 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF3Q13114 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF3Q13114 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF3Q13114 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF3Q13114 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF3Q13114 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRAF3Q13114 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRAF3Q13114 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3Q13114 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF3Q13114 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms