Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SREBF2Q12772 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SREBF2Q12772 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SREBF2Q12772 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SREBF2Q12772 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SREBF2Q12772 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SREBF2Q12772 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SREBF2Q12772 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SREBF2Q12772 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SREBF2Q12772 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SREBF2Q12772 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SREBF2Q12772 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SREBF2Q12772 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SREBF2Q12772 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SREBF2Q12772 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SREBF2Q12772 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SREBF2Q12772 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SREBF2Q12772 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SREBF2Q12772 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SREBF2Q12772 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SREBF2Q12772 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SREBF2Q12772 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SREBF2Q12772 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SREBF2Q12772 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SREBF2Q12772 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SREBF2Q12772 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SREBF2Q12772 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SREBF2Q12772 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SREBF2Q12772 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SREBF2Q12772 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SREBF2Q12772 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SREBF2Q12772 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SREBF2Q12772 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SREBF2Q12772 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SREBF2Q12772 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SREBF2Q12772 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SREBF2Q12772 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SREBF2Q12772 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SREBF2Q12772 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SREBF2Q12772 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SREBF2Q12772 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SREBF2Q12772 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SREBF2Q12772 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SREBF2Q12772 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SREBF2Q12772 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SREBF2Q12772 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SREBF2Q12772 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SREBF2Q12772 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SREBF2Q12772 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SREBF2Q12772 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SREBF2Q12772 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SREBF2Q12772 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SREBF2Q12772 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SREBF2Q12772 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SREBF2Q12772 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SREBF2Q12772 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SREBF2Q12772 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SREBF2Q12772 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SREBF2Q12772 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SREBF2Q12772 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SREBF2Q12772 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SREBF2Q12772 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SREBF2Q12772 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SREBF2Q12772 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SREBF2Q12772 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SREBF2Q12772 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SREBF2Q12772 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SREBF2Q12772 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SREBF2Q12772 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SREBF2Q12772 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SREBF2Q12772 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SREBF2Q12772 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SREBF2Q12772 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SREBF2Q12772 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SREBF2Q12772 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SREBF2Q12772 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SREBF2Q12772 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SREBF2Q12772 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SREBF2Q12772 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SREBF2Q12772 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SREBF2Q12772 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SREBF2Q12772 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SREBF2Q12772 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SREBF2Q12772 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SREBF2Q12772 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SREBF2Q12772 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SREBF2Q12772 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SREBF2Q12772 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SREBF2Q12772 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SREBF2Q12772 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SREBF2Q12772 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SREBF2Q12772 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SREBF2Q12772 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SREBF2Q12772 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SREBF2Q12772 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SREBF2Q12772 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SREBF2Q12772 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SREBF2Q12772 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SREBF2Q12772 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SREBF2Q12772 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
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