Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNA1Q09470 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
KCNA1Q09470 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNA1Q09470 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNA1Q09470 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNA1Q09470 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNA1Q09470 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNA1Q09470 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNA1Q09470 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNA1Q09470 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCNA1Q09470 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCNA1Q09470 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCNA1Q09470 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCNA1Q09470 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCNA1Q09470 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCNA1Q09470 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNA1Q09470 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNA1Q09470 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNA1Q09470 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNA1Q09470 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNA1Q09470 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNA1Q09470 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNA1Q09470 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNA1Q09470 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNA1Q09470 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNA1Q09470 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNA1Q09470 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNA1Q09470 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNA1Q09470 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNA1Q09470 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNA1Q09470 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNA1Q09470 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNA1Q09470 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNA1Q09470 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNA1Q09470 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNA1Q09470 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNA1Q09470 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
KCNA1Q09470 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNA1Q09470 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNA1Q09470 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNA1Q09470 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNA1Q09470 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNA1Q09470 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNA1Q09470 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNA1Q09470 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNA1Q09470 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNA1Q09470 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNA1Q09470 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNA1Q09470 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNA1Q09470 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNA1Q09470 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNA1Q09470 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNA1Q09470 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNA1Q09470 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNA1Q09470 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNA1Q09470 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNA1Q09470 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KCNA1Q09470 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
KCNA1Q09470 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KCNA1Q09470 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNA1Q09470 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNA1Q09470 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNA1Q09470 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNA1Q09470 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNA1Q09470 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNA1Q09470 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNA1Q09470 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNA1Q09470 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNA1Q09470 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNA1Q09470 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNA1Q09470 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNA1Q09470 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNA1Q09470 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNA1Q09470 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNA1Q09470 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNA1Q09470 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNA1Q09470 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNA1Q09470 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNA1Q09470 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNA1Q09470 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNA1Q09470 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNA1Q09470 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNA1Q09470 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNA1Q09470 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNA1Q09470 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNA1Q09470 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KCNA1Q09470 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KCNA1Q09470 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNA1Q09470 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNA1Q09470 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNA1Q09470 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNA1Q09470 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNA1Q09470 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNA1Q09470 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNA1Q09470 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNA1Q09470 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNA1Q09470 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNA1Q09470 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNA1Q09470 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNA1Q09470 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms