Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DEUP1Q05D60 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DEUP1Q05D60 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DEUP1Q05D60 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DEUP1Q05D60 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DEUP1Q05D60 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DEUP1Q05D60 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DEUP1Q05D60 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DEUP1Q05D60 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DEUP1Q05D60 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DEUP1Q05D60 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DEUP1Q05D60 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DEUP1Q05D60 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DEUP1Q05D60 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DEUP1Q05D60 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DEUP1Q05D60 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DEUP1Q05D60 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
DEUP1Q05D60 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DEUP1Q05D60 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DEUP1Q05D60 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DEUP1Q05D60 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DEUP1Q05D60 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DEUP1Q05D60 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DEUP1Q05D60 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DEUP1Q05D60 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DEUP1Q05D60 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DEUP1Q05D60 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DEUP1Q05D60 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DEUP1Q05D60 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
DEUP1Q05D60 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
DEUP1Q05D60 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
DEUP1Q05D60 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DEUP1Q05D60 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DEUP1Q05D60 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DEUP1Q05D60 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DEUP1Q05D60 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DEUP1Q05D60 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DEUP1Q05D60 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DEUP1Q05D60 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DEUP1Q05D60 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DEUP1Q05D60 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DEUP1Q05D60 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DEUP1Q05D60 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DEUP1Q05D60 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DEUP1Q05D60 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
DEUP1Q05D60 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DEUP1Q05D60 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DEUP1Q05D60 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DEUP1Q05D60 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DEUP1Q05D60 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DEUP1Q05D60 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DEUP1Q05D60 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DEUP1Q05D60 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DEUP1Q05D60 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DEUP1Q05D60 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DEUP1Q05D60 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DEUP1Q05D60 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
DEUP1Q05D60 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DEUP1Q05D60 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
DEUP1Q05D60 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
DEUP1Q05D60 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DEUP1Q05D60 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DEUP1Q05D60 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DEUP1Q05D60 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DEUP1Q05D60 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DEUP1Q05D60 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DEUP1Q05D60 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DEUP1Q05D60 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DEUP1Q05D60 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DEUP1Q05D60 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DEUP1Q05D60 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DEUP1Q05D60 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DEUP1Q05D60 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DEUP1Q05D60 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DEUP1Q05D60 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DEUP1Q05D60 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DEUP1Q05D60 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DEUP1Q05D60 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DEUP1Q05D60 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DEUP1Q05D60 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DEUP1Q05D60 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DEUP1Q05D60 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DEUP1Q05D60 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DEUP1Q05D60 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DEUP1Q05D60 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DEUP1Q05D60 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DEUP1Q05D60 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DEUP1Q05D60 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DEUP1Q05D60 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DEUP1Q05D60 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
DEUP1Q05D60 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DEUP1Q05D60 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DEUP1Q05D60 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DEUP1Q05D60 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DEUP1Q05D60 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
DEUP1Q05D60 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DEUP1Q05D60 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DEUP1Q05D60 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DEUP1Q05D60 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DEUP1Q05D60 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms