Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TLE4Q04727 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TLE4Q04727 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TLE4Q04727 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TLE4Q04727 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TLE4Q04727 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TLE4Q04727 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TLE4Q04727 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TLE4Q04727 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TLE4Q04727 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TLE4Q04727 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TLE4Q04727 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TLE4Q04727 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TLE4Q04727 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TLE4Q04727 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TLE4Q04727 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TLE4Q04727 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TLE4Q04727 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TLE4Q04727 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TLE4Q04727 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TLE4Q04727 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TLE4Q04727 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TLE4Q04727 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TLE4Q04727 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TLE4Q04727 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TLE4Q04727 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TLE4Q04727 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TLE4Q04727 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TLE4Q04727 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TLE4Q04727 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TLE4Q04727 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TLE4Q04727 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TLE4Q04727 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TLE4Q04727 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms