Protein–RNA interactions for Protein: P86397

HTD2, Hydroxyacyl-thioester dehydratase type 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTD2P86397 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTD2P86397 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTD2P86397 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTD2P86397 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTD2P86397 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTD2P86397 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTD2P86397 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HTD2P86397 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTD2P86397 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTD2P86397 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTD2P86397 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HTD2P86397 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HTD2P86397 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTD2P86397 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTD2P86397 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTD2P86397 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTD2P86397 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTD2P86397 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTD2P86397 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTD2P86397 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTD2P86397 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTD2P86397 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTD2P86397 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HTD2P86397 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTD2P86397 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTD2P86397 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTD2P86397 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTD2P86397 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTD2P86397 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTD2P86397 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HTD2P86397 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HTD2P86397 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HTD2P86397 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTD2P86397 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTD2P86397 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTD2P86397 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTD2P86397 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTD2P86397 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HTD2P86397 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTD2P86397 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTD2P86397 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTD2P86397 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTD2P86397 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTD2P86397 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTD2P86397 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTD2P86397 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTD2P86397 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTD2P86397 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTD2P86397 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTD2P86397 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTD2P86397 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTD2P86397 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTD2P86397 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTD2P86397 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTD2P86397 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTD2P86397 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTD2P86397 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HTD2P86397 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
HTD2P86397 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTD2P86397 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTD2P86397 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HTD2P86397 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTD2P86397 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTD2P86397 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTD2P86397 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTD2P86397 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTD2P86397 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTD2P86397 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTD2P86397 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTD2P86397 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTD2P86397 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTD2P86397 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTD2P86397 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTD2P86397 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HTD2P86397 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTD2P86397 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTD2P86397 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTD2P86397 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTD2P86397 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTD2P86397 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTD2P86397 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTD2P86397 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTD2P86397 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTD2P86397 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTD2P86397 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTD2P86397 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTD2P86397 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTD2P86397 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTD2P86397 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTD2P86397 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTD2P86397 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTD2P86397 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTD2P86397 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTD2P86397 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTD2P86397 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTD2P86397 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTD2P86397 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTD2P86397 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTD2P86397 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTD2P86397 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms