Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAE1P78406 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RAE1P78406 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAE1P78406 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAE1P78406 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAE1P78406 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAE1P78406 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAE1P78406 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAE1P78406 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAE1P78406 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAE1P78406 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAE1P78406 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAE1P78406 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAE1P78406 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAE1P78406 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RAE1P78406 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAE1P78406 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAE1P78406 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAE1P78406 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAE1P78406 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAE1P78406 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAE1P78406 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAE1P78406 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAE1P78406 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAE1P78406 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAE1P78406 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAE1P78406 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAE1P78406 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAE1P78406 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAE1P78406 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAE1P78406 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAE1P78406 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAE1P78406 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAE1P78406 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAE1P78406 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAE1P78406 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAE1P78406 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAE1P78406 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAE1P78406 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAE1P78406 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAE1P78406 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAE1P78406 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAE1P78406 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAE1P78406 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAE1P78406 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAE1P78406 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAE1P78406 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RAE1P78406 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RAE1P78406 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAE1P78406 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAE1P78406 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAE1P78406 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAE1P78406 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAE1P78406 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAE1P78406 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAE1P78406 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAE1P78406 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAE1P78406 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAE1P78406 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAE1P78406 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAE1P78406 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAE1P78406 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAE1P78406 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAE1P78406 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAE1P78406 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAE1P78406 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAE1P78406 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAE1P78406 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RAE1P78406 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAE1P78406 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAE1P78406 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAE1P78406 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAE1P78406 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAE1P78406 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAE1P78406 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RAE1P78406 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RAE1P78406 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAE1P78406 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAE1P78406 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RAE1P78406 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAE1P78406 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAE1P78406 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAE1P78406 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAE1P78406 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAE1P78406 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAE1P78406 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAE1P78406 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAE1P78406 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAE1P78406 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAE1P78406 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAE1P78406 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAE1P78406 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAE1P78406 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAE1P78406 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAE1P78406 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAE1P78406 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAE1P78406 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAE1P78406 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAE1P78406 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAE1P78406 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms