Protein–RNA interactions for Protein: P78385

KRT83, Keratin, type II cuticular Hb3, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT83P78385 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT83P78385 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT83P78385 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT83P78385 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT83P78385 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT83P78385 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT83P78385 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT83P78385 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT83P78385 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT83P78385 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT83P78385 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT83P78385 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT83P78385 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT83P78385 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT83P78385 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT83P78385 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT83P78385 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT83P78385 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT83P78385 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT83P78385 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT83P78385 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT83P78385 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT83P78385 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT83P78385 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KRT83P78385 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KRT83P78385 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KRT83P78385 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT83P78385 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT83P78385 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT83P78385 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT83P78385 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT83P78385 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT83P78385 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT83P78385 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT83P78385 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT83P78385 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT83P78385 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT83P78385 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT83P78385 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT83P78385 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT83P78385 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT83P78385 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT83P78385 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT83P78385 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT83P78385 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT83P78385 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT83P78385 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT83P78385 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT83P78385 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT83P78385 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT83P78385 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT83P78385 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT83P78385 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT83P78385 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT83P78385 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT83P78385 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT83P78385 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT83P78385 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT83P78385 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT83P78385 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT83P78385 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT83P78385 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT83P78385 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT83P78385 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT83P78385 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT83P78385 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT83P78385 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT83P78385 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT83P78385 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT83P78385 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT83P78385 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT83P78385 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT83P78385 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT83P78385 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT83P78385 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT83P78385 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT83P78385 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT83P78385 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT83P78385 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT83P78385 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT83P78385 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT83P78385 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT83P78385 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT83P78385 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT83P78385 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT83P78385 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT83P78385 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT83P78385 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT83P78385 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT83P78385 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT83P78385 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT83P78385 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT83P78385 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT83P78385 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT83P78385 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT83P78385 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT83P78385 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT83P78385 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT83P78385 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT83P78385 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms