Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3BP2P78314 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3BP2P78314 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3BP2P78314 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3BP2P78314 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3BP2P78314 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3BP2P78314 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3BP2P78314 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3BP2P78314 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3BP2P78314 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3BP2P78314 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3BP2P78314 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3BP2P78314 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3BP2P78314 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3BP2P78314 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3BP2P78314 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3BP2P78314 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3BP2P78314 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3BP2P78314 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3BP2P78314 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3BP2P78314 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3BP2P78314 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3BP2P78314 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3BP2P78314 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3BP2P78314 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3BP2P78314 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3BP2P78314 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3BP2P78314 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3BP2P78314 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3BP2P78314 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3BP2P78314 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3BP2P78314 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3BP2P78314 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3BP2P78314 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3BP2P78314 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2P78314 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2P78314 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2P78314 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2P78314 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2P78314 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SH3BP2P78314 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3BP2P78314 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SH3BP2P78314 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SH3BP2P78314 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3BP2P78314 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3BP2P78314 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3BP2P78314 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3BP2P78314 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3BP2P78314 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3BP2P78314 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3BP2P78314 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3BP2P78314 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3BP2P78314 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3BP2P78314 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3BP2P78314 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3BP2P78314 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3BP2P78314 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3BP2P78314 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3BP2P78314 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3BP2P78314 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
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