Protein–RNA interactions for Protein: P63316

TNNC1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC1P63316 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNC1P63316 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNC1P63316 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNC1P63316 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNC1P63316 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNC1P63316 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNC1P63316 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNC1P63316 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNC1P63316 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNC1P63316 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNC1P63316 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNC1P63316 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNC1P63316 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNC1P63316 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNC1P63316 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNC1P63316 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNC1P63316 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNC1P63316 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNC1P63316 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNC1P63316 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNC1P63316 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNC1P63316 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNC1P63316 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNC1P63316 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNC1P63316 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TNNC1P63316 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TNNC1P63316 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNC1P63316 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNC1P63316 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNC1P63316 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNC1P63316 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNC1P63316 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNC1P63316 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNC1P63316 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNC1P63316 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNC1P63316 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNC1P63316 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNC1P63316 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNC1P63316 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNC1P63316 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNC1P63316 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNC1P63316 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNC1P63316 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNC1P63316 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNC1P63316 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNC1P63316 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNC1P63316 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNC1P63316 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNC1P63316 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNC1P63316 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNC1P63316 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNC1P63316 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNC1P63316 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNC1P63316 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNC1P63316 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNC1P63316 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNC1P63316 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNC1P63316 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNC1P63316 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNC1P63316 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNC1P63316 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNC1P63316 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNC1P63316 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNC1P63316 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNC1P63316 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNC1P63316 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNC1P63316 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNC1P63316 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNC1P63316 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNC1P63316 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNC1P63316 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNC1P63316 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNC1P63316 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNC1P63316 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNC1P63316 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNC1P63316 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNC1P63316 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNC1P63316 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNC1P63316 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNC1P63316 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNC1P63316 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNC1P63316 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNC1P63316 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNC1P63316 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNC1P63316 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNC1P63316 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNC1P63316 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNC1P63316 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNC1P63316 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNC1P63316 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNC1P63316 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNC1P63316 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNC1P63316 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNC1P63316 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNC1P63316 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNC1P63316 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNC1P63316 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNC1P63316 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNC1P63316 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNC1P63316 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 224.8 ms