Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL39P62891 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL39P62891 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL39P62891 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL39P62891 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL39P62891 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL39P62891 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL39P62891 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL39P62891 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL39P62891 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL39P62891 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL39P62891 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL39P62891 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL39P62891 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL39P62891 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL39P62891 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL39P62891 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL39P62891 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL39P62891 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL39P62891 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL39P62891 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL39P62891 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL39P62891 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL39P62891 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL39P62891 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL39P62891 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL39P62891 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL39P62891 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL39P62891 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL39P62891 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL39P62891 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL39P62891 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL39P62891 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL39P62891 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL39P62891 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL39P62891 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL39P62891 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL39P62891 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL39P62891 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL39P62891 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL39P62891 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL39P62891 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL39P62891 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL39P62891 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL39P62891 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL39P62891 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL39P62891 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL39P62891 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL39P62891 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL39P62891 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL39P62891 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL39P62891 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL39P62891 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL39P62891 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL39P62891 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL39P62891 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL39P62891 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL39P62891 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL39P62891 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL39P62891 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL39P62891 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL39P62891 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL39P62891 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL39P62891 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL39P62891 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL39P62891 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL39P62891 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL39P62891 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPL39P62891 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPL39P62891 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPL39P62891 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPL39P62891 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPL39P62891 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P62891 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P62891 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P62891 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P62891 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P62891 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P62891 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P62891 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P62891 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P62891 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P62891 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P62891 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL39P62891 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL39P62891 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL39P62891 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL39P62891 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL39P62891 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL39P62891 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL39P62891 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL39P62891 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL39P62891 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL39P62891 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL39P62891 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL39P62891 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL39P62891 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL39P62891 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL39P62891 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL39P62891 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms