Protein–RNA interactions for Protein: P61601

NCALD, Neurocalcin-delta, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCALDP61601 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCALDP61601 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCALDP61601 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCALDP61601 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCALDP61601 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCALDP61601 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCALDP61601 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCALDP61601 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCALDP61601 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCALDP61601 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCALDP61601 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCALDP61601 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCALDP61601 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCALDP61601 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCALDP61601 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCALDP61601 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCALDP61601 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCALDP61601 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCALDP61601 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NCALDP61601 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCALDP61601 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCALDP61601 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCALDP61601 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCALDP61601 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCALDP61601 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCALDP61601 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCALDP61601 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCALDP61601 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCALDP61601 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCALDP61601 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCALDP61601 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCALDP61601 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCALDP61601 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCALDP61601 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCALDP61601 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCALDP61601 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCALDP61601 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCALDP61601 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCALDP61601 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NCALDP61601 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCALDP61601 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCALDP61601 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCALDP61601 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCALDP61601 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCALDP61601 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCALDP61601 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCALDP61601 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCALDP61601 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCALDP61601 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCALDP61601 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCALDP61601 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCALDP61601 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCALDP61601 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCALDP61601 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCALDP61601 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCALDP61601 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCALDP61601 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCALDP61601 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCALDP61601 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NCALDP61601 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCALDP61601 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCALDP61601 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NCALDP61601 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCALDP61601 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCALDP61601 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCALDP61601 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCALDP61601 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCALDP61601 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCALDP61601 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCALDP61601 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCALDP61601 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCALDP61601 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NCALDP61601 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCALDP61601 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCALDP61601 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCALDP61601 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCALDP61601 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCALDP61601 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCALDP61601 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCALDP61601 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCALDP61601 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCALDP61601 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCALDP61601 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCALDP61601 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NCALDP61601 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCALDP61601 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCALDP61601 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCALDP61601 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCALDP61601 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCALDP61601 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCALDP61601 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NCALDP61601 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCALDP61601 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCALDP61601 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCALDP61601 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCALDP61601 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCALDP61601 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCALDP61601 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCALDP61601 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCALDP61601 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.1 ms