Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVS71-1P61550 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVS71-1P61550 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVS71-1P61550 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVS71-1P61550 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVS71-1P61550 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVS71-1P61550 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVS71-1P61550 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVS71-1P61550 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVS71-1P61550 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVS71-1P61550 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVS71-1P61550 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVS71-1P61550 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVS71-1P61550 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVS71-1P61550 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVS71-1P61550 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVS71-1P61550 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERVS71-1P61550 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVS71-1P61550 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVS71-1P61550 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVS71-1P61550 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVS71-1P61550 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVS71-1P61550 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVS71-1P61550 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVS71-1P61550 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVS71-1P61550 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVS71-1P61550 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVS71-1P61550 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVS71-1P61550 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVS71-1P61550 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVS71-1P61550 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVS71-1P61550 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVS71-1P61550 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVS71-1P61550 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVS71-1P61550 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVS71-1P61550 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVS71-1P61550 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVS71-1P61550 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVS71-1P61550 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVS71-1P61550 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVS71-1P61550 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVS71-1P61550 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVS71-1P61550 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVS71-1P61550 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVS71-1P61550 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVS71-1P61550 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVS71-1P61550 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVS71-1P61550 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVS71-1P61550 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ERVS71-1P61550 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVS71-1P61550 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVS71-1P61550 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVS71-1P61550 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVS71-1P61550 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVS71-1P61550 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVS71-1P61550 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVS71-1P61550 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVS71-1P61550 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVS71-1P61550 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVS71-1P61550 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVS71-1P61550 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVS71-1P61550 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVS71-1P61550 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVS71-1P61550 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ERVS71-1P61550 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVS71-1P61550 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVS71-1P61550 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVS71-1P61550 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVS71-1P61550 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVS71-1P61550 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVS71-1P61550 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVS71-1P61550 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVS71-1P61550 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVS71-1P61550 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVS71-1P61550 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVS71-1P61550 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVS71-1P61550 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVS71-1P61550 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVS71-1P61550 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVS71-1P61550 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVS71-1P61550 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVS71-1P61550 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVS71-1P61550 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVS71-1P61550 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ERVS71-1P61550 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVS71-1P61550 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVS71-1P61550 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVS71-1P61550 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVS71-1P61550 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVS71-1P61550 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVS71-1P61550 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVS71-1P61550 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVS71-1P61550 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVS71-1P61550 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVS71-1P61550 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVS71-1P61550 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVS71-1P61550 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVS71-1P61550 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVS71-1P61550 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVS71-1P61550 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms