Protein–RNA interactions for Protein: P60891

PRPS1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1P60891 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPS1P60891 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPS1P60891 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPS1P60891 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPS1P60891 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPS1P60891 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPS1P60891 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPS1P60891 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPS1P60891 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPS1P60891 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPS1P60891 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPS1P60891 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPS1P60891 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPS1P60891 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPS1P60891 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPS1P60891 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPS1P60891 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPS1P60891 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPS1P60891 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPS1P60891 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPS1P60891 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPS1P60891 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPS1P60891 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPS1P60891 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPS1P60891 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPS1P60891 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPS1P60891 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPS1P60891 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRPS1P60891 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPS1P60891 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPS1P60891 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPS1P60891 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPS1P60891 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPS1P60891 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPS1P60891 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPS1P60891 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPS1P60891 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPS1P60891 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPS1P60891 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPS1P60891 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPS1P60891 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPS1P60891 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPS1P60891 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPS1P60891 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPS1P60891 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPS1P60891 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPS1P60891 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPS1P60891 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPS1P60891 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPS1P60891 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPS1P60891 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPS1P60891 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPS1P60891 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPS1P60891 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPS1P60891 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPS1P60891 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPS1P60891 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPS1P60891 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPS1P60891 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms