Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A3P48764 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A3P48764 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A3P48764 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A3P48764 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC9A3P48764 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9A3P48764 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9A3P48764 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9A3P48764 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9A3P48764 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9A3P48764 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9A3P48764 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9A3P48764 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9A3P48764 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A3P48764 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A3P48764 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A3P48764 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A3P48764 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A3P48764 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A3P48764 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A3P48764 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A3P48764 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A3P48764 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A3P48764 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A3P48764 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A3P48764 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A3P48764 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A3P48764 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A3P48764 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A3P48764 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A3P48764 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A3P48764 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A3P48764 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC9A3P48764 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC9A3P48764 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC9A3P48764 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A3P48764 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A3P48764 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A3P48764 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A3P48764 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A3P48764 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A3P48764 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A3P48764 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A3P48764 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A3P48764 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A3P48764 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A3P48764 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A3P48764 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A3P48764 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A3P48764 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A3P48764 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A3P48764 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A3P48764 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A3P48764 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A3P48764 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A3P48764 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A3P48764 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A3P48764 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A3P48764 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A3P48764 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A3P48764 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A3P48764 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A3P48764 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A3P48764 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A3P48764 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A3P48764 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A3P48764 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A3P48764 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A3P48764 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A3P48764 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A3P48764 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms