Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ALDH1A3P47895 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALDH1A3P47895 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALDH1A3P47895 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALDH1A3P47895 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALDH1A3P47895 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALDH1A3P47895 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALDH1A3P47895 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ALDH1A3P47895 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALDH1A3P47895 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALDH1A3P47895 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALDH1A3P47895 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALDH1A3P47895 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALDH1A3P47895 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ALDH1A3P47895 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALDH1A3P47895 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALDH1A3P47895 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALDH1A3P47895 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALDH1A3P47895 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALDH1A3P47895 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALDH1A3P47895 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALDH1A3P47895 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALDH1A3P47895 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALDH1A3P47895 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALDH1A3P47895 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALDH1A3P47895 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALDH1A3P47895 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALDH1A3P47895 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALDH1A3P47895 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALDH1A3P47895 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALDH1A3P47895 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ALDH1A3P47895 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALDH1A3P47895 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALDH1A3P47895 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALDH1A3P47895 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ALDH1A3P47895 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALDH1A3P47895 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALDH1A3P47895 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALDH1A3P47895 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALDH1A3P47895 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ALDH1A3P47895 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALDH1A3P47895 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALDH1A3P47895 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALDH1A3P47895 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALDH1A3P47895 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALDH1A3P47895 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALDH1A3P47895 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALDH1A3P47895 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALDH1A3P47895 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALDH1A3P47895 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALDH1A3P47895 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ALDH1A3P47895 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALDH1A3P47895 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALDH1A3P47895 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ALDH1A3P47895 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ALDH1A3P47895 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALDH1A3P47895 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALDH1A3P47895 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALDH1A3P47895 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALDH1A3P47895 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALDH1A3P47895 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALDH1A3P47895 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALDH1A3P47895 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALDH1A3P47895 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALDH1A3P47895 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALDH1A3P47895 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALDH1A3P47895 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALDH1A3P47895 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALDH1A3P47895 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ALDH1A3P47895 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALDH1A3P47895 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALDH1A3P47895 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALDH1A3P47895 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALDH1A3P47895 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALDH1A3P47895 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ALDH1A3P47895 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALDH1A3P47895 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ALDH1A3P47895 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALDH1A3P47895 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALDH1A3P47895 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALDH1A3P47895 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALDH1A3P47895 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALDH1A3P47895 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALDH1A3P47895 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALDH1A3P47895 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALDH1A3P47895 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALDH1A3P47895 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALDH1A3P47895 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALDH1A3P47895 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ALDH1A3P47895 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALDH1A3P47895 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALDH1A3P47895 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALDH1A3P47895 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALDH1A3P47895 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALDH1A3P47895 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALDH1A3P47895 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ALDH1A3P47895 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALDH1A3P47895 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ALDH1A3P47895 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALDH1A3P47895 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.2 ms