Protein–RNA interactions for Protein: P47888

OR3A3, Olfactory receptor 3A3, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OR3A3P47888 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OR3A3P47888 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OR3A3P47888 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OR3A3P47888 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OR3A3P47888 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
OR3A3P47888 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OR3A3P47888 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OR3A3P47888 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OR3A3P47888 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OR3A3P47888 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OR3A3P47888 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OR3A3P47888 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OR3A3P47888 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OR3A3P47888 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OR3A3P47888 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OR3A3P47888 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OR3A3P47888 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OR3A3P47888 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OR3A3P47888 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
OR3A3P47888 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OR3A3P47888 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OR3A3P47888 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
OR3A3P47888 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.27■■□□□ 1
OR3A3P47888 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OR3A3P47888 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.27■■□□□ 1
OR3A3P47888 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OR3A3P47888 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OR3A3P47888 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OR3A3P47888 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OR3A3P47888 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OR3A3P47888 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OR3A3P47888 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OR3A3P47888 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OR3A3P47888 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OR3A3P47888 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OR3A3P47888 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OR3A3P47888 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OR3A3P47888 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OR3A3P47888 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OR3A3P47888 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OR3A3P47888 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
OR3A3P47888 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OR3A3P47888 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OR3A3P47888 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OR3A3P47888 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OR3A3P47888 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OR3A3P47888 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OR3A3P47888 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
OR3A3P47888 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OR3A3P47888 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OR3A3P47888 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OR3A3P47888 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OR3A3P47888 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OR3A3P47888 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OR3A3P47888 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OR3A3P47888 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms