Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
IQGAP1P46940 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
IQGAP1P46940 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
IQGAP1P46940 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
IQGAP1P46940 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
IQGAP1P46940 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
IQGAP1P46940 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
IQGAP1P46940 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
IQGAP1P46940 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
IQGAP1P46940 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
IQGAP1P46940 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
IQGAP1P46940 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
IQGAP1P46940 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
IQGAP1P46940 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
IQGAP1P46940 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
IQGAP1P46940 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
IQGAP1P46940 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
IQGAP1P46940 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
IQGAP1P46940 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
IQGAP1P46940 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
IQGAP1P46940 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
IQGAP1P46940 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
IQGAP1P46940 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
IQGAP1P46940 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
IQGAP1P46940 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
IQGAP1P46940 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
IQGAP1P46940 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
IQGAP1P46940 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
IQGAP1P46940 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
IQGAP1P46940 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC36.16■■■■□ 3.38
IQGAP1P46940 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
IQGAP1P46940 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
IQGAP1P46940 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
IQGAP1P46940 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
IQGAP1P46940 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
IQGAP1P46940 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
IQGAP1P46940 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC36.14■■■■□ 3.38
IQGAP1P46940 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
IQGAP1P46940 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
IQGAP1P46940 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
IQGAP1P46940 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
IQGAP1P46940 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
IQGAP1P46940 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
IQGAP1P46940 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
IQGAP1P46940 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
IQGAP1P46940 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
IQGAP1P46940 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
IQGAP1P46940 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
IQGAP1P46940 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
IQGAP1P46940 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
IQGAP1P46940 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
IQGAP1P46940 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
IQGAP1P46940 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
IQGAP1P46940 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
IQGAP1P46940 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC36.1■■■■□ 3.37
IQGAP1P46940 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
IQGAP1P46940 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
IQGAP1P46940 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
IQGAP1P46940 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
IQGAP1P46940 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
IQGAP1P46940 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
IQGAP1P46940 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
IQGAP1P46940 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
IQGAP1P46940 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
IQGAP1P46940 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
IQGAP1P46940 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
IQGAP1P46940 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
IQGAP1P46940 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
IQGAP1P46940 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
IQGAP1P46940 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
IQGAP1P46940 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
IQGAP1P46940 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
IQGAP1P46940 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
IQGAP1P46940 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
IQGAP1P46940 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
IQGAP1P46940 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
IQGAP1P46940 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
IQGAP1P46940 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
IQGAP1P46940 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
IQGAP1P46940 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
IQGAP1P46940 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
IQGAP1P46940 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
IQGAP1P46940 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
IQGAP1P46940 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
IQGAP1P46940 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
IQGAP1P46940 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC36.02■■■■□ 3.36
IQGAP1P46940 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
IQGAP1P46940 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
IQGAP1P46940 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
IQGAP1P46940 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
IQGAP1P46940 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
IQGAP1P46940 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
IQGAP1P46940 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
IQGAP1P46940 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
IQGAP1P46940 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
IQGAP1P46940 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
IQGAP1P46940 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
IQGAP1P46940 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
IQGAP1P46940 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
IQGAP1P46940 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms