Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDKN1BP46527 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKN1BP46527 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKN1BP46527 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKN1BP46527 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKN1BP46527 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKN1BP46527 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKN1BP46527 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKN1BP46527 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKN1BP46527 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKN1BP46527 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKN1BP46527 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKN1BP46527 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKN1BP46527 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKN1BP46527 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKN1BP46527 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKN1BP46527 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKN1BP46527 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKN1BP46527 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKN1BP46527 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKN1BP46527 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKN1BP46527 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKN1BP46527 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKN1BP46527 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN1BP46527 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN1BP46527 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN1BP46527 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN1BP46527 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN1BP46527 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN1BP46527 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN1BP46527 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN1BP46527 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN1BP46527 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CDKN1BP46527 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms