Protein–RNA interactions for Protein: P35250

RFC2, Replication factor C subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC2P35250 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RFC2P35250 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RFC2P35250 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RFC2P35250 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RFC2P35250 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RFC2P35250 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RFC2P35250 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RFC2P35250 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RFC2P35250 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RFC2P35250 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RFC2P35250 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RFC2P35250 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RFC2P35250 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RFC2P35250 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RFC2P35250 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RFC2P35250 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RFC2P35250 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RFC2P35250 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RFC2P35250 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RFC2P35250 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RFC2P35250 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RFC2P35250 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RFC2P35250 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RFC2P35250 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RFC2P35250 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RFC2P35250 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RFC2P35250 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RFC2P35250 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RFC2P35250 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RFC2P35250 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RFC2P35250 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RFC2P35250 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RFC2P35250 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RFC2P35250 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RFC2P35250 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RFC2P35250 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RFC2P35250 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RFC2P35250 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RFC2P35250 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RFC2P35250 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RFC2P35250 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RFC2P35250 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RFC2P35250 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RFC2P35250 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RFC2P35250 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RFC2P35250 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RFC2P35250 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RFC2P35250 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RFC2P35250 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RFC2P35250 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RFC2P35250 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RFC2P35250 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RFC2P35250 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RFC2P35250 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RFC2P35250 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RFC2P35250 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RFC2P35250 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RFC2P35250 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RFC2P35250 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RFC2P35250 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RFC2P35250 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RFC2P35250 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RFC2P35250 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RFC2P35250 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RFC2P35250 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RFC2P35250 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RFC2P35250 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RFC2P35250 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RFC2P35250 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RFC2P35250 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RFC2P35250 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RFC2P35250 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RFC2P35250 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RFC2P35250 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFC2P35250 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFC2P35250 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFC2P35250 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFC2P35250 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RFC2P35250 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFC2P35250 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFC2P35250 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFC2P35250 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFC2P35250 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFC2P35250 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFC2P35250 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFC2P35250 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RFC2P35250 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RFC2P35250 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RFC2P35250 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RFC2P35250 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RFC2P35250 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RFC2P35250 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RFC2P35250 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RFC2P35250 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RFC2P35250 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFC2P35250 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFC2P35250 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFC2P35250 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFC2P35250 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFC2P35250 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms