Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN7P35236 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN7P35236 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN7P35236 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN7P35236 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN7P35236 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN7P35236 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN7P35236 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN7P35236 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN7P35236 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN7P35236 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN7P35236 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN7P35236 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN7P35236 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN7P35236 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN7P35236 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN7P35236 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN7P35236 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN7P35236 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN7P35236 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN7P35236 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN7P35236 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN7P35236 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN7P35236 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN7P35236 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN7P35236 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN7P35236 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN7P35236 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN7P35236 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN7P35236 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN7P35236 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN7P35236 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN7P35236 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN7P35236 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN7P35236 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN7P35236 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN7P35236 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN7P35236 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN7P35236 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN7P35236 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN7P35236 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN7P35236 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN7P35236 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN7P35236 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN7P35236 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN7P35236 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN7P35236 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN7P35236 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN7P35236 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN7P35236 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN7P35236 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN7P35236 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN7P35236 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN7P35236 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN7P35236 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN7P35236 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN7P35236 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms