Protein–RNA interactions for Protein: P32881

IFNA8, Interferon alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA8P32881 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNA8P32881 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNA8P32881 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNA8P32881 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNA8P32881 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNA8P32881 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNA8P32881 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNA8P32881 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNA8P32881 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNA8P32881 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNA8P32881 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNA8P32881 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNA8P32881 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNA8P32881 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNA8P32881 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNA8P32881 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNA8P32881 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNA8P32881 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNA8P32881 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNA8P32881 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNA8P32881 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNA8P32881 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
IFNA8P32881 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNA8P32881 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNA8P32881 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNA8P32881 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNA8P32881 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNA8P32881 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNA8P32881 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNA8P32881 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNA8P32881 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNA8P32881 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNA8P32881 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNA8P32881 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNA8P32881 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNA8P32881 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNA8P32881 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNA8P32881 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNA8P32881 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNA8P32881 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNA8P32881 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNA8P32881 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNA8P32881 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNA8P32881 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNA8P32881 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNA8P32881 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNA8P32881 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNA8P32881 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNA8P32881 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNA8P32881 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNA8P32881 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNA8P32881 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNA8P32881 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNA8P32881 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNA8P32881 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNA8P32881 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNA8P32881 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNA8P32881 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNA8P32881 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNA8P32881 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNA8P32881 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
IFNA8P32881 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNA8P32881 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNA8P32881 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNA8P32881 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNA8P32881 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNA8P32881 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNA8P32881 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNA8P32881 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNA8P32881 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNA8P32881 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNA8P32881 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNA8P32881 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNA8P32881 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNA8P32881 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNA8P32881 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNA8P32881 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNA8P32881 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNA8P32881 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNA8P32881 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNA8P32881 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNA8P32881 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNA8P32881 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNA8P32881 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNA8P32881 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNA8P32881 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNA8P32881 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNA8P32881 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNA8P32881 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNA8P32881 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNA8P32881 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNA8P32881 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNA8P32881 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFNA8P32881 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFNA8P32881 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNA8P32881 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNA8P32881 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNA8P32881 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNA8P32881 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNA8P32881 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms