Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3AP31941 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3AP31941 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3AP31941 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3AP31941 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3AP31941 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOBEC3AP31941 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3AP31941 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC3AP31941 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC3AP31941 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC3AP31941 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC3AP31941 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC3AP31941 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC3AP31941 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC3AP31941 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms