Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
LTKP29376 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
LTKP29376 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
LTKP29376 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
LTKP29376 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
LTKP29376 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
LTKP29376 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC35.97■■■■□ 3.35
LTKP29376 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
LTKP29376 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
LTKP29376 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
LTKP29376 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
LTKP29376 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
LTKP29376 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
LTKP29376 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC35.95■■■■□ 3.35
LTKP29376 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
LTKP29376 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
LTKP29376 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
LTKP29376 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
LTKP29376 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
LTKP29376 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
LTKP29376 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
LTKP29376 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
LTKP29376 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
LTKP29376 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
LTKP29376 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
LTKP29376 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
LTKP29376 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
LTKP29376 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
LTKP29376 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
LTKP29376 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
LTKP29376 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
LTKP29376 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
LTKP29376 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
LTKP29376 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
LTKP29376 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
LTKP29376 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
LTKP29376 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
LTKP29376 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
LTKP29376 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
LTKP29376 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
LTKP29376 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
LTKP29376 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
LTKP29376 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
LTKP29376 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
LTKP29376 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
LTKP29376 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
LTKP29376 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
LTKP29376 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
LTKP29376 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
LTKP29376 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
LTKP29376 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
LTKP29376 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
LTKP29376 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
LTKP29376 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
LTKP29376 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
LTKP29376 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
LTKP29376 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
LTKP29376 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
LTKP29376 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
LTKP29376 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
LTKP29376 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC35.81■■■■□ 3.32
LTKP29376 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
LTKP29376 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
LTKP29376 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
LTKP29376 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC35.8■■■■□ 3.32
LTKP29376 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
LTKP29376 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
LTKP29376 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
LTKP29376 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
LTKP29376 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
LTKP29376 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
LTKP29376 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
LTKP29376 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.77■■■■□ 3.32
LTKP29376 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
LTKP29376 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
LTKP29376 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
LTKP29376 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
LTKP29376 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
LTKP29376 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
LTKP29376 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
LTKP29376 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
LTKP29376 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
LTKP29376 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
LTKP29376 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
LTKP29376 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
LTKP29376 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
LTKP29376 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
LTKP29376 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
LTKP29376 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
LTKP29376 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
LTKP29376 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
LTKP29376 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
LTKP29376 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
LTKP29376 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
LTKP29376 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
LTKP29376 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
LTKP29376 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
LTKP29376 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
LTKP29376 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
LTKP29376 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.7 ms