Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMA3P25788 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMA3P25788 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMA3P25788 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMA3P25788 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMA3P25788 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMA3P25788 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMA3P25788 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMA3P25788 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMA3P25788 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMA3P25788 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMA3P25788 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMA3P25788 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMA3P25788 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMA3P25788 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMA3P25788 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMA3P25788 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMA3P25788 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMA3P25788 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMA3P25788 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMA3P25788 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMA3P25788 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMA3P25788 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMA3P25788 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSMA3P25788 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSMA3P25788 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMA3P25788 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMA3P25788 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMA3P25788 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMA3P25788 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMA3P25788 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMA3P25788 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMA3P25788 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMA3P25788 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMA3P25788 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMA3P25788 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMA3P25788 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMA3P25788 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMA3P25788 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMA3P25788 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMA3P25788 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMA3P25788 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMA3P25788 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMA3P25788 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMA3P25788 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMA3P25788 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMA3P25788 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMA3P25788 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMA3P25788 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMA3P25788 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMA3P25788 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMA3P25788 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMA3P25788 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMA3P25788 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMA3P25788 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMA3P25788 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMA3P25788 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMA3P25788 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMA3P25788 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMA3P25788 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMA3P25788 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMA3P25788 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMA3P25788 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMA3P25788 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSMA3P25788 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSMA3P25788 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSMA3P25788 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSMA3P25788 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMA3P25788 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMA3P25788 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMA3P25788 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMA3P25788 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMA3P25788 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMA3P25788 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMA3P25788 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMA3P25788 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMA3P25788 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMA3P25788 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMA3P25788 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMA3P25788 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMA3P25788 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMA3P25788 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMA3P25788 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMA3P25788 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMA3P25788 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMA3P25788 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMA3P25788 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMA3P25788 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMA3P25788 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMA3P25788 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMA3P25788 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMA3P25788 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMA3P25788 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMA3P25788 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMA3P25788 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMA3P25788 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMA3P25788 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMA3P25788 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMA3P25788 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMA3P25788 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms