Protein–RNA interactions for Protein: P23508

MCC, Colorectal mutant cancer protein, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCP23508 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MCCP23508 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
MCCP23508 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
MCCP23508 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
MCCP23508 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
MCCP23508 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
MCCP23508 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MCCP23508 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MCCP23508 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MCCP23508 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MCCP23508 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MCCP23508 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MCCP23508 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MCCP23508 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MCCP23508 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MCCP23508 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MCCP23508 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MCCP23508 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MCCP23508 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MCCP23508 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MCCP23508 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MCCP23508 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MCCP23508 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MCCP23508 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MCCP23508 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MCCP23508 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MCCP23508 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MCCP23508 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MCCP23508 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MCCP23508 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MCCP23508 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MCCP23508 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MCCP23508 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MCCP23508 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MCCP23508 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MCCP23508 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MCCP23508 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
MCCP23508 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MCCP23508 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MCCP23508 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MCCP23508 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MCCP23508 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MCCP23508 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MCCP23508 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MCCP23508 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MCCP23508 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MCCP23508 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MCCP23508 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MCCP23508 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MCCP23508 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MCCP23508 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.82■■■□□ 2.37
MCCP23508 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MCCP23508 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MCCP23508 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MCCP23508 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MCCP23508 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MCCP23508 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MCCP23508 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MCCP23508 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MCCP23508 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MCCP23508 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
MCCP23508 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MCCP23508 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MCCP23508 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MCCP23508 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MCCP23508 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MCCP23508 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MCCP23508 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MCCP23508 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
MCCP23508 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MCCP23508 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MCCP23508 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MCCP23508 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MCCP23508 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MCCP23508 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MCCP23508 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MCCP23508 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
MCCP23508 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MCCP23508 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MCCP23508 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MCCP23508 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MCCP23508 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MCCP23508 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
MCCP23508 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MCCP23508 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
MCCP23508 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MCCP23508 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MCCP23508 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MCCP23508 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MCCP23508 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
MCCP23508 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
MCCP23508 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
MCCP23508 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MCCP23508 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
MCCP23508 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MCCP23508 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
MCCP23508 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MCCP23508 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MCCP23508 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MCCP23508 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms