Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACO1P21399 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ACO1P21399 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ACO1P21399 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ACO1P21399 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ACO1P21399 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ACO1P21399 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ACO1P21399 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ACO1P21399 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ACO1P21399 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ACO1P21399 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACO1P21399 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACO1P21399 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACO1P21399 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACO1P21399 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACO1P21399 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACO1P21399 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACO1P21399 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACO1P21399 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACO1P21399 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACO1P21399 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACO1P21399 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACO1P21399 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACO1P21399 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACO1P21399 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACO1P21399 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACO1P21399 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACO1P21399 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACO1P21399 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACO1P21399 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACO1P21399 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACO1P21399 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACO1P21399 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACO1P21399 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACO1P21399 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACO1P21399 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACO1P21399 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACO1P21399 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACO1P21399 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACO1P21399 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACO1P21399 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACO1P21399 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACO1P21399 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACO1P21399 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACO1P21399 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACO1P21399 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACO1P21399 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACO1P21399 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACO1P21399 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACO1P21399 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACO1P21399 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ACO1P21399 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACO1P21399 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACO1P21399 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACO1P21399 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACO1P21399 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACO1P21399 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACO1P21399 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACO1P21399 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACO1P21399 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACO1P21399 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACO1P21399 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACO1P21399 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ACO1P21399 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
ACO1P21399 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACO1P21399 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACO1P21399 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ACO1P21399 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACO1P21399 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACO1P21399 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACO1P21399 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACO1P21399 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACO1P21399 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACO1P21399 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACO1P21399 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACO1P21399 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACO1P21399 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACO1P21399 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACO1P21399 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACO1P21399 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACO1P21399 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ACO1P21399 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACO1P21399 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACO1P21399 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ACO1P21399 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACO1P21399 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACO1P21399 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ACO1P21399 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ACO1P21399 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ACO1P21399 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ACO1P21399 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ACO1P21399 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ACO1P21399 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACO1P21399 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACO1P21399 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACO1P21399 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACO1P21399 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACO1P21399 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACO1P21399 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACO1P21399 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms