Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATF7P17544 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATF7P17544 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATF7P17544 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATF7P17544 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATF7P17544 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATF7P17544 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATF7P17544 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATF7P17544 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATF7P17544 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ATF7P17544 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATF7P17544 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATF7P17544 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATF7P17544 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATF7P17544 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATF7P17544 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATF7P17544 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATF7P17544 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATF7P17544 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATF7P17544 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ATF7P17544 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATF7P17544 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATF7P17544 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ATF7P17544 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATF7P17544 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATF7P17544 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATF7P17544 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF7P17544 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF7P17544 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF7P17544 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF7P17544 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF7P17544 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF7P17544 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF7P17544 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF7P17544 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF7P17544 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF7P17544 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF7P17544 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF7P17544 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF7P17544 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF7P17544 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF7P17544 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF7P17544 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF7P17544 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF7P17544 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF7P17544 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF7P17544 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF7P17544 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF7P17544 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF7P17544 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF7P17544 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF7P17544 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF7P17544 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF7P17544 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF7P17544 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF7P17544 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF7P17544 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF7P17544 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF7P17544 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF7P17544 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF7P17544 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF7P17544 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF7P17544 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF7P17544 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF7P17544 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF7P17544 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF7P17544 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF7P17544 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF7P17544 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF7P17544 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF7P17544 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF7P17544 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF7P17544 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF7P17544 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF7P17544 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF7P17544 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF7P17544 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF7P17544 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ATF7P17544 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATF7P17544 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATF7P17544 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF7P17544 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF7P17544 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF7P17544 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF7P17544 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF7P17544 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF7P17544 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATF7P17544 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATF7P17544 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATF7P17544 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATF7P17544 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATF7P17544 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATF7P17544 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATF7P17544 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ATF7P17544 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATF7P17544 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATF7P17544 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATF7P17544 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATF7P17544 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATF7P17544 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms