Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB42P16452 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB42P16452 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB42P16452 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB42P16452 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB42P16452 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB42P16452 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB42P16452 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB42P16452 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB42P16452 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB42P16452 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB42P16452 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB42P16452 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB42P16452 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB42P16452 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPB42P16452 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPB42P16452 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPB42P16452 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPB42P16452 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPB42P16452 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EPB42P16452 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPB42P16452 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EPB42P16452 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
EPB42P16452 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
EPB42P16452 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPB42P16452 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPB42P16452 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPB42P16452 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPB42P16452 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EPB42P16452 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPB42P16452 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EPB42P16452 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPB42P16452 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPB42P16452 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPB42P16452 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EPB42P16452 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPB42P16452 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPB42P16452 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPB42P16452 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPB42P16452 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPB42P16452 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPB42P16452 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPB42P16452 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPB42P16452 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EPB42P16452 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPB42P16452 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
EPB42P16452 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPB42P16452 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPB42P16452 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPB42P16452 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPB42P16452 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPB42P16452 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPB42P16452 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPB42P16452 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPB42P16452 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPB42P16452 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPB42P16452 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPB42P16452 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EPB42P16452 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPB42P16452 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPB42P16452 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EPB42P16452 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPB42P16452 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPB42P16452 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPB42P16452 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPB42P16452 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPB42P16452 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPB42P16452 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPB42P16452 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPB42P16452 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPB42P16452 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPB42P16452 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPB42P16452 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPB42P16452 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EPB42P16452 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EPB42P16452 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPB42P16452 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPB42P16452 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EPB42P16452 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPB42P16452 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPB42P16452 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPB42P16452 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPB42P16452 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPB42P16452 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPB42P16452 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPB42P16452 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPB42P16452 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPB42P16452 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPB42P16452 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPB42P16452 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPB42P16452 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPB42P16452 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPB42P16452 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EPB42P16452 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPB42P16452 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPB42P16452 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPB42P16452 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPB42P16452 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPB42P16452 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPB42P16452 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms