Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATA1P15976 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATA1P15976 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GATA1P15976 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATA1P15976 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATA1P15976 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATA1P15976 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATA1P15976 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATA1P15976 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GATA1P15976 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GATA1P15976 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GATA1P15976 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GATA1P15976 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GATA1P15976 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA1P15976 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA1P15976 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA1P15976 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA1P15976 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA1P15976 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA1P15976 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA1P15976 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA1P15976 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GATA1P15976 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GATA1P15976 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GATA1P15976 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA1P15976 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GATA1P15976 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GATA1P15976 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GATA1P15976 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA1P15976 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA1P15976 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA1P15976 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA1P15976 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA1P15976 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA1P15976 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA1P15976 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA1P15976 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA1P15976 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA1P15976 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA1P15976 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA1P15976 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATA1P15976 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATA1P15976 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATA1P15976 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATA1P15976 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATA1P15976 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATA1P15976 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATA1P15976 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATA1P15976 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATA1P15976 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATA1P15976 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATA1P15976 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATA1P15976 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATA1P15976 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATA1P15976 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATA1P15976 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATA1P15976 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATA1P15976 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATA1P15976 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATA1P15976 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATA1P15976 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GATA1P15976 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GATA1P15976 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GATA1P15976 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GATA1P15976 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GATA1P15976 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GATA1P15976 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GATA1P15976 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GATA1P15976 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GATA1P15976 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GATA1P15976 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GATA1P15976 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GATA1P15976 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GATA1P15976 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GATA1P15976 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GATA1P15976 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GATA1P15976 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GATA1P15976 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GATA1P15976 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GATA1P15976 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GATA1P15976 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GATA1P15976 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GATA1P15976 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GATA1P15976 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GATA1P15976 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GATA1P15976 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GATA1P15976 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GATA1P15976 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GATA1P15976 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GATA1P15976 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GATA1P15976 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GATA1P15976 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GATA1P15976 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GATA1P15976 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GATA1P15976 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GATA1P15976 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GATA1P15976 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GATA1P15976 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GATA1P15976 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GATA1P15976 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms