Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF35P13682 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF35P13682 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF35P13682 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF35P13682 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF35P13682 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF35P13682 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF35P13682 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF35P13682 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF35P13682 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF35P13682 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF35P13682 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF35P13682 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF35P13682 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF35P13682 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF35P13682 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF35P13682 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF35P13682 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF35P13682 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF35P13682 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF35P13682 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF35P13682 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF35P13682 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF35P13682 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF35P13682 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF35P13682 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZNF35P13682 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF35P13682 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF35P13682 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF35P13682 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF35P13682 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF35P13682 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF35P13682 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF35P13682 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF35P13682 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF35P13682 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF35P13682 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF35P13682 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF35P13682 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF35P13682 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF35P13682 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF35P13682 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF35P13682 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF35P13682 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF35P13682 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF35P13682 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF35P13682 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF35P13682 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF35P13682 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF35P13682 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF35P13682 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF35P13682 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF35P13682 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF35P13682 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF35P13682 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms