Protein–RNA interactions for Protein: P13010

XRCC5, X-ray repair cross-complementing protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC5P13010 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
XRCC5P13010 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
XRCC5P13010 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
XRCC5P13010 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
XRCC5P13010 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
XRCC5P13010 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
XRCC5P13010 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
XRCC5P13010 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
XRCC5P13010 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
XRCC5P13010 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
XRCC5P13010 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
XRCC5P13010 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
XRCC5P13010 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
XRCC5P13010 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
XRCC5P13010 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
XRCC5P13010 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
XRCC5P13010 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
XRCC5P13010 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
XRCC5P13010 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
XRCC5P13010 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
XRCC5P13010 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
XRCC5P13010 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
XRCC5P13010 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
XRCC5P13010 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
XRCC5P13010 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
XRCC5P13010 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
XRCC5P13010 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
XRCC5P13010 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
XRCC5P13010 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
XRCC5P13010 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
XRCC5P13010 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
XRCC5P13010 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
XRCC5P13010 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
XRCC5P13010 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
XRCC5P13010 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
XRCC5P13010 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
XRCC5P13010 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
XRCC5P13010 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
XRCC5P13010 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
XRCC5P13010 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
XRCC5P13010 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
XRCC5P13010 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
XRCC5P13010 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
XRCC5P13010 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
XRCC5P13010 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
XRCC5P13010 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
XRCC5P13010 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
XRCC5P13010 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
XRCC5P13010 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
XRCC5P13010 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
XRCC5P13010 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
XRCC5P13010 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
XRCC5P13010 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
XRCC5P13010 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
XRCC5P13010 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
XRCC5P13010 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
XRCC5P13010 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
XRCC5P13010 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
XRCC5P13010 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
XRCC5P13010 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
XRCC5P13010 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
XRCC5P13010 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
XRCC5P13010 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
XRCC5P13010 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
XRCC5P13010 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
XRCC5P13010 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
XRCC5P13010 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
XRCC5P13010 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
XRCC5P13010 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
XRCC5P13010 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
XRCC5P13010 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
XRCC5P13010 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
XRCC5P13010 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
XRCC5P13010 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
XRCC5P13010 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
XRCC5P13010 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
XRCC5P13010 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
XRCC5P13010 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
XRCC5P13010 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
XRCC5P13010 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
XRCC5P13010 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
XRCC5P13010 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
XRCC5P13010 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
XRCC5P13010 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
XRCC5P13010 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
XRCC5P13010 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
XRCC5P13010 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
XRCC5P13010 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
XRCC5P13010 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
XRCC5P13010 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
XRCC5P13010 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
XRCC5P13010 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
XRCC5P13010 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
XRCC5P13010 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
XRCC5P13010 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
XRCC5P13010 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
XRCC5P13010 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
XRCC5P13010 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
XRCC5P13010 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
XRCC5P13010 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms