Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ODC1P11926 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ODC1P11926 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ODC1P11926 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ODC1P11926 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ODC1P11926 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ODC1P11926 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ODC1P11926 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ODC1P11926 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ODC1P11926 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ODC1P11926 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ODC1P11926 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ODC1P11926 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ODC1P11926 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ODC1P11926 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ODC1P11926 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ODC1P11926 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ODC1P11926 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ODC1P11926 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ODC1P11926 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ODC1P11926 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ODC1P11926 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ODC1P11926 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ODC1P11926 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ODC1P11926 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ODC1P11926 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ODC1P11926 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ODC1P11926 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ODC1P11926 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ODC1P11926 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ODC1P11926 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ODC1P11926 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ODC1P11926 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ODC1P11926 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ODC1P11926 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ODC1P11926 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ODC1P11926 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ODC1P11926 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ODC1P11926 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ODC1P11926 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ODC1P11926 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ODC1P11926 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ODC1P11926 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ODC1P11926 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ODC1P11926 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ODC1P11926 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ODC1P11926 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ODC1P11926 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ODC1P11926 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ODC1P11926 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ODC1P11926 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ODC1P11926 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ODC1P11926 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ODC1P11926 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ODC1P11926 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ODC1P11926 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ODC1P11926 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ODC1P11926 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ODC1P11926 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ODC1P11926 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ODC1P11926 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ODC1P11926 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ODC1P11926 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ODC1P11926 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ODC1P11926 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ODC1P11926 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ODC1P11926 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ODC1P11926 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ODC1P11926 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ODC1P11926 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ODC1P11926 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ODC1P11926 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ODC1P11926 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ODC1P11926 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ODC1P11926 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ODC1P11926 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ODC1P11926 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ODC1P11926 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ODC1P11926 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ODC1P11926 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ODC1P11926 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ODC1P11926 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ODC1P11926 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ODC1P11926 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ODC1P11926 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ODC1P11926 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ODC1P11926 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ODC1P11926 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ODC1P11926 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ODC1P11926 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ODC1P11926 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ODC1P11926 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ODC1P11926 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ODC1P11926 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ODC1P11926 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ODC1P11926 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ODC1P11926 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ODC1P11926 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ODC1P11926 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ODC1P11926 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119 ms