Protein–RNA interactions for Protein: P11279

LAMP1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP1P11279 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMP1P11279 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMP1P11279 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms