Protein–RNA interactions for Protein: P0CG23

ZNF853, Zinc finger protein 853, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF853P0CG23 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ZNF853P0CG23 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ZNF853P0CG23 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ZNF853P0CG23 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ZNF853P0CG23 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ZNF853P0CG23 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ZNF853P0CG23 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ZNF853P0CG23 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ZNF853P0CG23 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
ZNF853P0CG23 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
ZNF853P0CG23 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ZNF853P0CG23 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ZNF853P0CG23 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ZNF853P0CG23 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNF853P0CG23 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNF853P0CG23 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNF853P0CG23 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNF853P0CG23 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNF853P0CG23 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ZNF853P0CG23 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ZNF853P0CG23 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ZNF853P0CG23 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ZNF853P0CG23 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ZNF853P0CG23 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF853P0CG23 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF853P0CG23 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF853P0CG23 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF853P0CG23 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF853P0CG23 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZNF853P0CG23 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZNF853P0CG23 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZNF853P0CG23 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZNF853P0CG23 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZNF853P0CG23 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZNF853P0CG23 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
ZNF853P0CG23 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZNF853P0CG23 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZNF853P0CG23 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZNF853P0CG23 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZNF853P0CG23 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZNF853P0CG23 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZNF853P0CG23 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
ZNF853P0CG23 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZNF853P0CG23 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZNF853P0CG23 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZNF853P0CG23 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZNF853P0CG23 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZNF853P0CG23 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZNF853P0CG23 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZNF853P0CG23 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZNF853P0CG23 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZNF853P0CG23 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZNF853P0CG23 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZNF853P0CG23 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZNF853P0CG23 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZNF853P0CG23 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
ZNF853P0CG23 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZNF853P0CG23 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZNF853P0CG23 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZNF853P0CG23 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ZNF853P0CG23 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ZNF853P0CG23 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZNF853P0CG23 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZNF853P0CG23 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZNF853P0CG23 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZNF853P0CG23 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZNF853P0CG23 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZNF853P0CG23 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZNF853P0CG23 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZNF853P0CG23 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZNF853P0CG23 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZNF853P0CG23 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZNF853P0CG23 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
ZNF853P0CG23 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ZNF853P0CG23 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ZNF853P0CG23 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ZNF853P0CG23 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ZNF853P0CG23 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ZNF853P0CG23 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
ZNF853P0CG23 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ZNF853P0CG23 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ZNF853P0CG23 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ZNF853P0CG23 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ZNF853P0CG23 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ZNF853P0CG23 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ZNF853P0CG23 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ZNF853P0CG23 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ZNF853P0CG23 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ZNF853P0CG23 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
ZNF853P0CG23 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ZNF853P0CG23 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ZNF853P0CG23 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ZNF853P0CG23 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ZNF853P0CG23 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ZNF853P0CG23 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ZNF853P0CG23 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ZNF853P0CG23 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ZNF853P0CG23 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ZNF853P0CG23 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
ZNF853P0CG23 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms